Recenzie genetika (Apríl 2020)

MikroRNA v sieti Hox: zjavná súvislosť so zadnou prevalenciou

MikroRNA v sieti Hox: zjavná súvislosť so zadnou prevalenciou

abstraktné Faktory transkripcie homeoboxu (Hox) prepožičiavajú embryám stavovcov axiálne súradnice prednej časti (AP). Gény Hox sa nachádzajú v zhlukoch, ktoré tiež obsahujú gény pre mikroRNA (miRNA). Naša analýza predpokladaných miRNA cieľov naznačuje, že mixy Hoxovho zhlukového klastra prednostne zacieľujú na Hox mRNA. Ďalej sa predpokladané

V skratke

V skratke

Genetické obrazovky Genómová transgénna knižnica RNAi pre podmienenú inaktiváciu génov v Drosophile . Dietzl, G. a kol . Príroda 12. júla 2007 (doi: 10, 1038 / príroda05954) Tento článok popisuje generovanie a validáciu rozsiahlej transgénnej knižnice na skríning RNAi v Drosophila melanogaster , čo umožňuje analyzovať génové funkcie vo všetkých tkanivách a vývojových štádiách. Transgény obsahujú konštrukty

Chovateľstvo a epigenetika: prospešné aj škodlivé účinky

Chovateľstvo a epigenetika: prospešné aj škodlivé účinky

predmety Epigenetics inbreeding Korešpondenčný článok Christian Biémont (Biémont, C. Inbreeding effects in epigenetic éra. Nature Rev. Genet. 11 , 234 (2010) 1 a články (Charlesworth, D. & Willis, JH Genetika inbreeding depresie. Nature Rev Genet. 10 , 783 - 796 (2009) 2, 3, ktorý si zaslúži ďalší dialóg. Tieto práce sum

Trasy na porušenie a ochranu genetického súkromia

Trasy na porušenie a ochranu genetického súkromia

predmety Publikovanie a archivácia údajov DNA sekvenovanie Etika Genetické databázy Pôvodný článok bol uverejnený 8. mája 2014 Genetics 15 , 409 - 421 (2014) V uvedenom článku bola uvedená nesprávna citácia v odkaze 107. Citácia mala byť: Ayday, E., Raisaro, JL, McLaren, PJ, Fellay, J. & Hubaux, J

Dedičné prínosy verzus genetická architektúra

Dedičné prínosy verzus genetická architektúra

predmety Genetika chorôb epidemiológia Genetická variácia Asociačné štúdie týkajúce sa celého genómu Dedičné kvantitatívne rysy Lekárska genomika Sekvenovanie novej generácie So záujmom čítame korešpondenciu od Evansa a Kellera (Použitie metód rozdelenia heritability na preskúmanie genetickej architektúry. Nat. Rev. Genet. //Doi.

Zmeny rýchlosti mutácií v eukaryotoch: vývojové implikácie mechanizmov špecifických pre danú lokalitu

Zmeny rýchlosti mutácií v eukaryotoch: vývojové implikácie mechanizmov špecifických pre danú lokalitu

Recenzia Baer et al ., „Zmena rýchlosti mutácií vo viacbunkových eukaryotoch: príčiny a následky“ 1 presne vystihuje tenor väčšiny literatúry o vývoji rýchlosti mutácií. Aj keď sa uznáva, že miera mutácií sa môže v jednotlivých genómoch výrazne líšiť, táto literatúra väčšinou ignoruje alebo minimalizuje špeciálne vlastnosti a dôsledky mutačných mechanizmov špecifických pre danú lokalitu. Preto by sme do zoznamu autorov „päť kritic

Posudzovanie a riadenie rizika pri zdieľaní súhrnných údajov o genetických variantoch

Posudzovanie a riadenie rizika pri zdieľaní súhrnných údajov o genetických variantoch

predmety Genetické databázy Genetická variácia Asociačné štúdie týkajúce sa celého genómu Pôvodný článok bol uverejnený 16. septembra 2011 Genetics Reviews Nature 12 , 730–736 (2011) Vo vyššie uvedenom článku bolo pre spoločnosť GWAS Central poskytnuté nesprávne prepojenie. Správny odkaz mal byť //w

Cloud computing pre analýzu genomických dát a spoluprácu

Cloud computing pre analýzu genomických dát a spoluprácu

predmety Výpočtová biológia a bioinformatika Genetické databázy Genomics Sekvenovanie novej generácie Údaje z výskumu Pôvodný článok bol uverejnený 30. januára 2018 Recenzia prírody Genetics doi: 10.1038 / nr.2017.113 (2018) Vyššie uvedený článok pôvodne uviedol, že „FireCloud a CGC sa pri výpočte a ukladaní údajov spoliehajú na AWS a platformu Google Cloud Platform. Okrem poplatkov za tieto kom

LCN DNA: dôkaz bez akýchkoľvek pochybností? - odozva

LCN DNA: dôkaz bez akýchkoľvek pochybností? - odozva

V článku McCartneyho (LCN DNA: dôkaz bez akýchkoľvek pochybností? Nature Rev. Genet. 9 , 325 (2008)) 1 sa uvádza, že pokus Omagh odhalil závažné nedostatky v dôkazoch o DNA. Médiá však nenahlásili väčšinu dôkazov, a to ani v samotnom rozsudku. Úlohou vedca je bezdôvodne radiť súdu o význame dôkazov. Z toho vyplýva, že nesch

Zlepšovanie ľudskej forenznej techniky prostredníctvom pokroku v oblasti genetiky, genomiky a molekulárnej biológie

Zlepšovanie ľudskej forenznej techniky prostredníctvom pokroku v oblasti genetiky, genomiky a molekulárnej biológie

predmety Bioinformatics Rakovina genomika Etika Genetické techniky Genomics Molekulárna biológia Spoločenské vedy technológie Pôvodný článok bol uverejnený 18. februára 2011 Genetics Reviews Nature 12 , 179–192 (2011) Na obrázku 3 tohto článku bolo červené pole obklopujúce druhé, tretie a štvrté oko v treťom stĺpci nesprávne umiestnené. Kolónka by mala obklopova

Empirické testy zloženej epistázy

Empirické testy zloženej epistázy

predmety Genetická interakcia Genetická variácia Štatistické metódy V článku prehľadu (Detekcia interakcií gén-gén, ktorý je základom ľudských chorôb. Príroda Rev. Genet. 10 , 392–404 (2009)) 1 a kdekoľvek inde 2 , Cordell tvrdí, že štatistické testy interakcií sú obmedzené na objasnenie epistázy u biologickejší význam tohto pojmu - to znamená, keď je účinok konkrétneho genetického variantu maskovaný variantom na inom mieste 3, 3 („zložená epistáza“ 5 ). Predpokladajme, že dva genetické faktory, X1

Zaobchádzanie so špeciálnymi procesmi ako so zložitými znakmi

Zaobchádzanie so špeciálnymi procesmi ako so zložitými znakmi

V boxe 4 svojho prehľadu 1 , Noor a Feder uviedli desať príkladov génov zapojených do vytvárania reprodukčnej bariéry, ktorá by mohla viesť k udalostiam špekulácie. Autori napísali: „... mohli by sme byť v budúcnosti prekvapení, keď sa zmapujú ďalšie prekážky a dokazujú, že zahŕňajú mechanizmy, ako je meiotická jazda alebo genomický konflikt, vo väčšej miere, ako sa v súčasnosti oceňuje“ (strana 858). Jedným z argumentov, ktoré vychádzajú

Testy asociácie pre zriedkavé varianty: skríning mutácie skríningu prípadov

Testy asociácie pre zriedkavé varianty: skríning mutácie skríningu prípadov

predmety Genetika rakoviny Genetické testovanie Asociačné štúdie týkajúce sa celého genómu Zriedkavé varianty Dva nedávne recenzie, jeden v Nature Reviews Genetics od Bansal et al . (Stratégie štatistickej analýzy pre asociačné štúdie zahŕňajúce zriedkavé varianty. Nature Rev. Genet. 11 , 773–785 (2010))

Odpoveď: O hodnote analýzy genotypu-fenotypu založenej na haplotypoch ao transformácii údajov vo farmakogenéze a -genomike

Odpoveď: O hodnote analýzy genotypu-fenotypu založenej na haplotypoch ao transformácii údajov vo farmakogenéze a -genomike

Vítam pripomienky Vormfeldeho a Brockmöllera, ktoré podľa môjho názoru v mojom úvodnom článku nepovažujem za úplne protichodné, ale za to, že som išiel ďalej, ako som mal priestor. Rád by som však predložil niekoľko pripomienok k ich pripomienkam. Haplotypové analýzy môžu často prinášať výhody v porovnaní s analýzou jedného SNP súčasne, najmä keď, ako som uviedol na strane 787 môjho prehľadu 1 , existuje viac úzko spojených funkčných variantov pôsobiacich v cis . Tento potenciálny prírastok energie je v