Dedičnosť (Apríl 2020)

Minulé klimatické zmeny vysvetľujú fylogeografiu Vitellaria paradoxa nad Afrikou

Minulé klimatické zmeny vysvetľujú fylogeografiu Vitellaria paradoxa nad Afrikou

predmety biogeography Zmena podnebia fylogenetický Rastlinná genetika Pôvodný článok bol uverejnený 16. marca 2011 Oprava : Dedičnosť (2011) 107 , 174–186; doi: 10, 1038 / hdy.2011.5 Po uverejnení začiatkom tohto roka v ročníku 107 si autori všimli typografickú chybu týkajúcu sa éry štúdie v časti Diskusia. V odseku pod nadpisom

Sortiment príbuzných húfov mladistvých v populáciách divej guppy

Sortiment príbuzných húfov mladistvých v populáciách divej guppy

predmety Behaviorálna ekológia Genetická variácia Modelové bezstavovce abstraktné Zoskupovanie poskytuje jednotlivcom veľa potenciálnych výhod, pokiaľ ide o pástenie a ochranu pred predátormi. Navrhuje sa však, že jednotlivci by mohli získať ďalšie výhody, pokiaľ ide o nepriamu kondíciu zoskupením s príbuznými. Prekvapivo zostáva gen

Klastre U1 snDNA v kobylkách: chromozomálna dynamika a genomická organizácia

Klastre U1 snDNA v kobylkách: chromozomálna dynamika a genomická organizácia

predmety cytogenetika abstraktné Spliceozóm, tvorený proteínovým súborom spojeným s malou nukleárnou RNA (snRNA), je zodpovedný za maturáciu mRNA prostredníctvom odstránenia intrónu. Medzi snRNA génmi je U1 všeobecne konzervovaná opakovaná sekvencia. Aby sme odhalili chromozomálnu / genomickú dynamiku tejto mnohonásobnej rodiny v kobylkách, mapovali sme gény U1 pomocou fluorescenčnej in situ hybridizácie u 70 druhov patriacich do čeľadí Proscopiidae, Pyrgomorphidae, Ommexechidae, Romaleidae a Acrididae. U všetkých druhov boli po

Priestorová heterogenita v sile selekcie proti škodlivým alelám a zaťaženiu mutáciami

Priestorová heterogenita v sile selekcie proti škodlivým alelám a zaťaženiu mutáciami

predmety Evolučná ekológia mutácie abstraktné Podľa súčasných odhadov mier genómovej škodlivej mutácie (ktoré sú často rádovo 0, 1–1) môže byť v mnohých populáciách dôležitá záťaž mutácií (definovaná ako zníženie priemernej zdatnosti populácie v dôsledku prítomnosti škodlivých alel). V tomto článku používam multilokusové

Demografická história, súčasné rozšírenie a budúce výzvy v oblasti riadenia populácie diviakov na Balkáne av Európe

Demografická história, súčasné rozšírenie a budúce výzvy v oblasti riadenia populácie diviakov na Balkáne av Európe

predmety Genetické markery Techniky založené na PCR abstraktné Diviak ( Sus scrofa ), jeden z najrozšírenejších druhov voľne žijúcich živočíchov, vstúpil do fázy neustáleho rastu v Európe a možno ho dokonca považovať za škodcu. Analyzovali sme variabilitu mikrosatelitov u 723 diviakov z celej Európy, vrátane severného dinárskeho Balkánu. Naše ciele boli: (1) defi

Genetická a funkčná modularita: ako organizmus vyrieši takmer nekonečný genetický / environmentálny problémový priestor?

Genetická a funkčná modularita: ako organizmus vyrieši takmer nekonečný genetický / environmentálny problémový priestor?

predmety Experimentálne organizmy Genetická variácia Modularita, pojem, že skupina položiek spolu funguje a sú menej prepojené s položkami v iných skupinách, je kľúčovým konceptom podporujúcim početné oblasti výskumu od kvantitatívnej genetiky po výpočtovú biológiu. Z genetického hľadiska sa variačný modul skladá zo zvláštností, ktoré sa navzájom líšia a sú nezávislé od iných modulov (Wagner a Altenberg, 1996). Z hľadiska molekulárnej biologie je f

Zmeny a obmedzenia vývoja a vývoja rastlín

Zmeny a obmedzenia vývoja a vývoja rastlín

abstraktné Cieľom tohto krátkeho prehľadu je zvážiť vzájomne prepojené javy fenotypovej variácie a genetického obmedzenia vzhľadom na diverzitu rastlín. Unikátne aspekty rastlín vrátane zvyku v sediacom stave, modulárneho rastu a rôznych vývojových programov vyjadrených na úrovni fytoméru si zaslúžia osobitné preskúmanie genetického základu ich fenotypovej variácie a spôsobu, akým prežívajú a unikajú genetickým obmedzeniam. Početné štúdie QTL s divými a domes

Zohľadnil sa teoretický rámec populačnej genetiky so somatickými mutáciami: aplikácia na kopírovanie variácií počtu ľudí

Zohľadnil sa teoretický rámec populačnej genetiky so somatickými mutáciami: aplikácia na kopírovanie variácií počtu ľudí

predmety mutácie Populačná genetika Štrukturálne variácie abstraktné Populačná genetika sa tradične zameriava na dynamiku frekvencií alel získaných mutáciami na zárodočných líniách, pretože iba také mutácie sú dedičné. Typické experimenty s genotypizáciou však používajú DNA z niektorých somatických tkanív, napríklad z krvi, ktorá pri súčasnej generácii nesie somatické mutácie, okrem mutácií v zárodočnej línii, ktoré sa nahromadili od posledného spoločného predka vzorky. Táto bežná prax môže niekedy spôsobiť nesprávne

Viacnásobné genomické podpisy výberu u kôz a oviec pochádzajúcich z horúceho suchého prostredia

Viacnásobné genomické podpisy výberu u kôz a oviec pochádzajúcich z horúceho suchého prostredia

predmety Evolučná biológia genetika abstraktné Kozy a ovce sú všestranné domestikáty, ktoré boli integrované do rôznych prostredí a výrobných systémov. Prirodzený a umelý výber formoval variáciu týchto dvoch druhov, ale prírodný výber zohrával hlavnú úlohu medzi domácimi stádami. Na skúmanie signálov príro

Časová variabilita v peľovej disperznej a šľachtiteľskej štruktúre neotropického stromu opeľovaného včelami

Časová variabilita v peľovej disperznej a šľachtiteľskej štruktúre neotropického stromu opeľovaného včelami

predmety Modelové rastliny Rozmnožovanie rastlín opelenie abstraktné Odchýlky v období kvitnutia v čase kvitnutia, synchrónnosti a dĺžky kvitnutia a kolísania v hojnosti opeľovačov môžu spôsobiť odchýlku v rozptylovej vzdialenosti peľu. V tejto štúdii sme analyzovali časovú variabilitu v peľovej disperznej a šľachtiteľskej štruktúre u druhu neotropického stromu Tabebuia aurea (Bignoniaceae) a vyhodnotili sme rozptyl peľu medzi populáciou vo vnútri rezervy a náplastou izolovaných jedincov na okraji rezervy a testovali sme hypotéza, že izolovaní jedinci sa potápajú peľom. Vzorky sa odobrali zo vš

Odolnosť genetiky fragmentácie lesov - už to nie je paradox - sme sa len pozerali na zlé miesto

Odolnosť genetiky fragmentácie lesov - už to nie je paradox - sme sa len pozerali na zlé miesto

predmety lesníctvo Populačná genetika Pôvodný článok bol uverejnený 15. júla 2015 Oprava: Dedičnosť (2015) 115, 97–99; doi: 10, 1038 / hdy.2015.40 Autori by chceli zmeniť dátum nasledujúceho odkazu z rokov 2010 na 2011. Správny odkaz by mal vyzerať takto: Bacles CFE, Jump AS (2011). Zohľadňujúc pohľ

Asociačná štúdia s viacnásobnými znakmi založená na analýze hlavných komponentov reziduálnej kovariančnej matice

Asociačná štúdia s viacnásobnými znakmi založená na analýze hlavných komponentov reziduálnej kovariančnej matice

predmety Asociačné štúdie týkajúce sa celého genómu Korigendum k tomuto článku bolo uverejnené 11. marca 2015 abstraktné Vzhľadom na nevýhody vykonávania viacrozmernej analýzy na mapovanie viacerých znakov v asociačnej štúdii zameranej na celú genóm (GWAS) sa analýza hlavných komponentov (PCA) často používa na generovanie nezávislých „nadradených znakov“ z pôvodných viacrozmerných fenotypových znakov na univariačnú analýzu. Odhady parametrov v tomto rámci však ne

Tok génov a štruktúra populácie obyčajných poľnohospodárskych voľne žijúcich druhov (Microtus agrestis) v rôznych režimoch správy pôdy

Tok génov a štruktúra populácie obyčajných poľnohospodárskych voľne žijúcich druhov (Microtus agrestis) v rôznych režimoch správy pôdy

predmety poľnohospodárstvo Ochranná biológia Populačná genetika abstraktné Skúmal sa vplyv krajinnej štruktúry a manažmentu pôdy na šírenie populácií voľne žijúcich druhov obývajúcich poľnohospodársku krajinu so zameraním na hraboša poľného ( Microtus agrestis ) v troch rôznych oblastiach v Dánsku pomocou molekulárnych genetických markerov. Hlavnými hypotézami boli: i)

Bryan Clarke

Bryan Clarke

predmety Vedecká komunita Bryan Clarke, ktorý zomrel vo veku 81 rokov, bol priekopníkom ekologickej genetiky. Študoval pod vedením EB Forda a AJ Caina v Oxforde a bol súčasťou generácie, ktorá zachránila populačnú a evolučnú biológiu pred zdĺhavým flirtovaním so Scyllou zmrazenej matematickej presnosti, ktorú nezasiahli fakty a Charybdis o zbere údajov bez nápadov. Pri pohľade na 50. r

Genetická architektúra rezistencie u dafnie je hostiteľom dvoch druhov hostiteľských parazitov

Genetická architektúra rezistencie u dafnie je hostiteľom dvoch druhov hostiteľských parazitov

predmety Vývoj parazitov Genetika parazitov abstraktné Pochopenie genetickej architektúry odolnosti hostiteľa je kľúčom k pochopeniu vývoja interakcií medzi hostiteľom a parazitom. Evolučné modely často predpokladajú jednoduchú genetiku založenú na niekoľkých lokusoch a silnej epistáze. Nie je však známe,

Kvetinová evolúcia: Jednostranná evolúcia alebo dvojica? Odpoveď Ennosovi

Kvetinová evolúcia: Jednostranná evolúcia alebo dvojica? Odpoveď Ennosovi

Aj keď sa termín „koevolúcia“ vytvoril pred menej ako 50 rokmi (Ehrlich a Raven, 1964), viac ako 100 rokov pred týmto dátumom Darwin prvýkrát opísal postup, ktorý zodpovedá za prispôsobenie dĺžok jazyka a rúrky včelích druhov a ďateliny, ktorú majú. navštívené (Darwin, 1859). O tomto procese vysvetli

Kvantitatívne genetické variácie v kontrole ovariálnej apoptózy v rôznych prostrediach

Kvantitatívne genetické variácie v kontrole ovariálnej apoptózy v rôznych prostrediach

abstraktné Strata plodnosti u inak zdravých jedincov môže byť evolučným hlavolamom. Väčšina štúdií o vývoji post-reprodukčného života sa zameriava na fitness účinky prežitia po veku poslednej reprodukcie. Doplnkovým prístupom, ktorý sa do značnej miery zanedbáva, je rozvíjať chápanie povahy variácií v mechanizme, ktorý je príčinou straty plodnosti, apoptózy vaječníkov. Zmeny v genetike, ktoré sú základo

Antagonistická pleiotropia môže pomôcť pri výbere na úrovni populácie pri udržiavaní genetického polymorfizmu pre rýchlosť prenosu v modelovej fytopatogénnej hube.

Antagonistická pleiotropia môže pomôcť pri výbere na úrovni populácie pri udržiavaní genetického polymorfizmu pre rýchlosť prenosu v modelovej fytopatogénnej hube.

abstraktné Teoreticky sa ukázalo, že podmienky na udržanie polymorfizmu v pleiotropných lokusoch s antagonistickými účinkami na zložky fitness sú dosť reštriktívne. V tomto prípade používame model metapopulácie na skúmanie toho, či by antagonistická pleiotropia mohla pomôcť udržať polymorfizmus zahŕňajúci bežné škodlivé alely vo fytopatogénnej hube Microbotryum violaceum . Táto huba spôsobuje ochorenie

Rozsiahla mitochondriálna introgresia u severoamerických čajok čiernych (Larus marinus) z čajky americkej (Larus smithsonianus) s malým dopadom na jadrovú DNA

Rozsiahla mitochondriálna introgresia u severoamerických čajok čiernych (Larus marinus) z čajky americkej (Larus smithsonianus) s malým dopadom na jadrovú DNA

predmety Evolučná biológia Populačná genetika abstraktné Nedávne genetické štúdie ukázali, že miera introgresie medzi lokusmi sa môže značne líšiť v závislosti od ich umiestnenia v genóme. Konkrétne bolo hlásených niekoľko prípadov madronukleárnych nezhôd pre celý rad organizmov. V tejto štúdii skúmame prí

O úlohe, ktorú zohráva nosnosť a veľkosť predkov počas rozširovania rozsahu

O úlohe, ktorú zohráva nosnosť a veľkosť predkov počas rozširovania rozsahu

predmety Evolučná teória abstraktné Väčšina druhov je štruktúrovaná a na skúmanie ich histórie boli navrhnuté rôzne populačné genetické modely. Pokiaľ ide o matematickú sledovateľnosť, väčšina z týchto modelov zjednodušuje predpoklad rovnováhy. Zameriame sa na vlastnosti priestorovo explicitného modelu nerovnováhy, rozšírenie rozsahu (RE). Napriek ich veľkému množstvu

Zmena preferencie partnera v hybridnej zóne domácej myši

Zmena preferencie partnera v hybridnej zóne domácej myši

abstraktné Je známe, že k premiestneniu reprodukčného charakteru dochádza na hraniciach sekundárnej kontaktnej zóny medzi dvoma európskymi poddruhmi domácej myši (v Jutsku v Dánsku), kde dochádza k selekcii proti hybridizácii. Táto štúdia hodnotila vzorce preferencie partnera v prirodzene sa vyskytujúcich hybridoch dvoch poddruhov. U samcov a samíc

Čo vysvetľuje vzácne a nápadné farby slimáka? Test údajov z časových radov proti modelom driftu, migrácie alebo výberu

Čo vysvetľuje vzácne a nápadné farby slimáka? Test údajov z časových radov proti modelom driftu, migrácie alebo výberu

predmety Genetická variácia abstraktné Je zaujímavé, že nápadné farebné morfy dravých druhov sa môžu udržiavať pri nízkych frekvenciách popri kryptických morfách. Negatívny výber závislý od frekvencie predátormi pomocou vyhľadávacích obrázkov („apostatický výber“) sa často navrhuje bez odmietnutia alternatívnych vysvetlení. Použitím prístupu maximálnej pravd

Vysoká chromozómová diverzita Y a nízka príbuznosť medzi otcovskými líniami v komunálnom meradle v západoeurópskych dolných krajinách počas stanovovania priezviska

Vysoká chromozómová diverzita Y a nízka príbuznosť medzi otcovskými líniami v komunálnom meradle v západoeurópskych dolných krajinách počas stanovovania priezviska

predmety Štrukturálne variácie abstraktné V obciach, mestách západnej Európy pred 17. storočím sú obmedzené znalosti o biologickej príbuznosti medzi občanmi a demografickej dynamike. Kombináciou genotypov Y-chromozómov, podrobných rodokmeňov a údajov o priezviskách v prísnom genetickom genealogickom prístupe je možné poskytnúť pohľad na genetickú diverzitu a súvislosť medzi pôvodnými otcovskými líniami v rámci konkrétnej komunity v čase prijatia priezviska. Na získanie týchto poznatkov bolo

Hádanka s hmyzím endosymbiontom

Hádanka s hmyzím endosymbiontom

Výskum za posledných 20 rokov ukázal, že veľká časť druhov hmyzu má intímne súvislosti so symbiotickými baktériami, ktoré majú často zásadný vplyv na ich biológiu. Niektorí symbionti sú vzájomní občania, ktorí zvyšujú telesnú kondíciu svojho hostiteľa, zatiaľ čo v iných prípadoch hostiteľ nezíska žiadny úžitok ani nenosí mikroorganizmus. Baktérie, ktoré neprinášajú úžitok ich

Dedičnosť miery rozptylu a ďalších životných charakteristík v fritilárnom motýle Glanville

Dedičnosť miery rozptylu a ďalších životných charakteristík v fritilárnom motýle Glanville

abstraktné Poznanie odchýlok a dedičností ( h 2 ) črty životnej histórie v populáciách žijúcich v prírodných podmienkach je potrebné na mechanické pochopenie príslušných vývojových procesov. Odhadol som dedičnosť niekoľkých znakov dejepisu života, vrátane miery rozptýlenia, telesnej hmotnosti, veku pri prvej reprodukcii, hmotnosti vajec, veľkosti spojky a celoživotného reprodukčného úspechu, v glanville fritillary butterfly ( Melitaea cinxia ) pomocou regresie rodičov a potomkov. Pokusy sa uskutočňovali v poľnýc

Posuny rozsahov Potentilla fruticosa na náhornej plošine Qinghai-Tibetan počas glaciálnych a interglaciálnych období odhalené variáciou sekvencie chloroplastov DNA

Posuny rozsahov Potentilla fruticosa na náhornej plošine Qinghai-Tibetan počas glaciálnych a interglaciálnych období odhalené variáciou sekvencie chloroplastov DNA

abstraktné Plocha Qinghai-Tibetan je jedným z najrozsiahlejších biotopov alpských rastlín na svete. Preto modely genetickej variácie v populáciách na náhornej plošine môžu odhaliť podrobnú demografickú históriu alpínskych rastlín. Analyzovali sme geografickú štruktúru variácie sekvencie K chloroplastovej rohože K u potentilly fruticosa L. (Rosaceae), kríka, kto

Molekulárne a bunkové mechanizmy diverzity v rámci odrôd viniča

Molekulárne a bunkové mechanizmy diverzity v rámci odrôd viniča

abstraktné Odroda viniča sa skladá z radu klonov pochádzajúcich z vegetatívneho rozmnožovania z jedinej vybranej vínnej révy vypestovanej z jedinej sadenice. Väčšina klonov v odrode je identická, ale niektoré môžu vykazovať odlišné genotypy a do istej miery odlišné fenotypy. Polymorfizmus je spôsobený hlavne somatickými mutáciami, ktoré sa prirodzene vyskytujú počas rastu rastlín. Ukázalo sa, že za genetickú

Genetické mapovanie sterilných génov s epistázou v spätnom krížení

Genetické mapovanie sterilných génov s epistázou v spätnom krížení

predmety Genetická interakcia Genetické mapovanie Hybridizácia rastlín abstraktné Mapovanie sterilných génov je základným problémom, ktorý by sa mal vyriešiť pri skúmaní mechanizmu sterility pri širokej hybridizácii rastlín. Doteraz vyvinuté metódy však nemôžu riešiť problém mapovania sterilných lokusov epistázou. V tejto štúdii sme vyvinul

Charakterizácia röntgenových kvetinových mutantov nesúcich delécie na S-lokusu vzdialenej Turnera subulata

Charakterizácia röntgenových kvetinových mutantov nesúcich delécie na S-lokusu vzdialenej Turnera subulata

predmety Modelové rastliny mutácie Rastlinná genetika Pôvodný článok bol uverejnený 14. apríla 2010 Oprava: Dedičnosť (2010) 105, 235–243; doi: 10, 1038 / hdy.2010.39; uverejnené online 14. apríla 2010 Autori objavili chybu, ktorú by chceli napraviť. Obrázok 3, Charakterizácia 12 S- lokusových mutantov, ukazuje dva markery ( RP81E18 a P9SP1 ) vo vzdialenostiach <0, 5 a 0, 5 cM. Skutočná vzdialeno

Detekcia epistatických interakcií v asociáciách mapujúcich populácie: príklad z tetraploidných zemiakov

Detekcia epistatických interakcií v asociáciách mapujúcich populácie: príklad z tetraploidných zemiakov

predmety Výpočtové modely Genetické mapovanie Rastlinná genetika abstraktné Očakáva sa, že epistatické interakcie medzi lokusmi významne prispejú k zmene kvantitatívnych znakov. Cieľom nášho výskumu bolo (i) porovnať klasický zmiešaný model s kombinovaným zmiešaným modelom a analýzu variančného prístupu na detekciu epistatických interakcií; ii) pomocou počítačových simulácií skúma štatistickú silu na zisťovanie adistatívnych - aditívnych, aditívnych - dominancií a dominancie - dominancie epistatických interakcií a iii) zisťovania epistatických interakcií medzi kandidátnymi génmi na odolnosť voč

Rýchlosť somatickej škodlivej mutácie v drevine: odhad z fenotypových údajov

Rýchlosť somatickej škodlivej mutácie v drevine: odhad z fenotypových údajov

predmety inbreeding mutácie Rastlinná genetika abstraktné Vykonali sme kontrolované kríženia v populáciách dlhožijúceho klonového kríka Vaccinium angustifolium (čučoriedka nízka), aby sme odhadli príbuzné depresie a parametre mutácie spojené so somatickou škodlivou mutáciou. Hladina depresie pri krížení bola vysoká a mnoho rastlín nedokázalo po samoopelení oplodniť ovocie. Porovnali sme tiež ovocný s

Kontrastné reakcie na selekciu v triedach I a IIa, ktoré sú hlavnými histokompatibilnými markermi lososa

Kontrastné reakcie na selekciu v triedach I a IIa, ktoré sú hlavnými histokompatibilnými markermi lososa

predmety Evolučná ekológia Genetické markery ichtyologie Populačná genetika abstraktné Porovnanie úrovní a vzorcov genetickej variácie v prirodzených populáciách buď v lokusoch, alebo proti neutrálnemu očakávaniu môže poskytnúť pohľad na lokusovo špecifické rozdiely v sile a smere vývojových síl. Oba prístupy sme použili

Nízka genetická diverzita a silná populačná štruktúra formovaná fragmentáciou antropogénnych biotopov u kriticky ohrozeného primáta, Trachypithecus leucocephalus

Nízka genetická diverzita a silná populačná štruktúra formovaná fragmentáciou antropogénnych biotopov u kriticky ohrozeného primáta, Trachypithecus leucocephalus

predmety Ochranná biológia Populačná genetika abstraktné Fragmentácia biotopu môže výrazne ovplyvniť genetickú štruktúru populácie a znížiť genetickú diverzitu a životaschopnosť malých a izolovaných populácií. Ligúr obyčajný ( Trachypithecus leucocephalus ) je kriticky ohrozený druh primátov žijúci vo vysoko fragmentovanom a človekom modifikovanom biotopu v južnej Číne. Preskúmali sme populačnú genetick

Analýza štruktúry, diverzity a jemného mapovania Mendelovských znakov u tradičných kurčiat a vidieckych kurčiat

Analýza štruktúry, diverzity a jemného mapovania Mendelovských znakov u tradičných kurčiat a vidieckych kurčiat

predmety Genetická variácia Asociačné štúdie týkajúce sa celého genómu Genotypizácia a haplotypovanie Populačná genetika abstraktné Rozsiahla fenotypová variácia je bežným znakom medzi vidieckymi kurčatami, ktoré sa vyskytujú vo väčšine rozvojového sveta, a v tradičných chovoch kurčiat, ktoré boli umelo vybrané pre znaky, ako je napríklad odroda peria. Predkladáme tu hodnotenie tra

RNAi a epigenetika: Pol IV je dohadzovač malých RNA stretávajúcich sa s chromatínom

RNAi a epigenetika: Pol IV je dohadzovač malých RNA stretávajúcich sa s chromatínom

U rôznych druhov eukaryotov môže dvojreťazcová RNA (dsRNA) spôsobiť sekvenciu špecifickú sekvenciu špecifickú pre celý rad javov umlčania génov, a to buď na úrovni transkripcie alebo na úrovni po transkripcii (Matzke a Birchler, 2005). Hlavnou biologickou úlohou takéhoto umlčania je obvykle ochrana pred invazívnymi nukleovými kyselinami vrátane vírusov a retrotranspozónov a udržanie chromozomálnej stability. V rastlinných bunkách dsR

Tajomstvo úhora: čas robí zmenu

Tajomstvo úhora: čas robí zmenu

Populačné genetické štúdie, ktoré vykazujú zdanlivo negatívne výsledky, napríklad nedostatok významných rozdielov, sa zriedka ocitnú v titulkoch popredných vedeckých časopisov. Práca Palm a kol. (2009) to však robí presne pomocou komplexných časových údajov, ktoré ukazujú, že napriek niekoľkým nedávnym tvrdeniam možno úhora európskeho ( Anguilla anguilla ) stále považovať za jedinú priestorovo homogénnu populáciu. Životný cyklus úhorov v Európe bol p

Odhadovanie disperzie anizotropného peľu: prípadová štúdia v Quercus lobata

Odhadovanie disperzie anizotropného peľu: prípadová štúdia v Quercus lobata

abstraktné Distribúcia peľu je dôležitým prvkom veľkosti susedstva rastlinných populácií. Väčšina metód zameraných na odhad disperznej krivky predpokladá, že rozptyl peľu je izotropný, ale dôkazy naznačujú, že tento predpoklad neplatí pre mnoho druhov rastlín, najmä pre druhy opeľované vetrom, ktoré sú počas opeľovacieho obdobia vystavené prevládajúcim vetrom. Navrhujeme spôsob detekcie anizot

Čo spôsobuje zmeny párenia v rastlinách? Arabidopsis lyrata ako prípadová štúdia

Čo spôsobuje zmeny párenia v rastlinách? Arabidopsis lyrata ako prípadová štúdia

predmety Vlastná nekompatibilita Korigendum k tomuto článku bolo uverejnené 7. decembra 2016 abstraktné Genetické rozpady nekompatibility (SI) a následný systém párenia sa prekrýva s príbuzenstvom, ktoré už desaťročia zaujalo evolučných genetikov. Väčšina našich vedomostí je odvodená z medzidruhového porovnania medzi druhmi plemenitby a ich príbuznými, ktorých sa vyskytujú, pričom závery môžu byť zmätené sekundárnymi mutáciami, ktoré vznikli po počiatočnej strate SI. Tu študujeme intrašpecifické rozdelenie

Vyčisťovanie škodlivých mutácií v programoch ochrany: kombinácia optimálnych príspevkov s inbrednými páreniami

Vyčisťovanie škodlivých mutácií v programoch ochrany: kombinácia optimálnych príspevkov s inbrednými páreniami

predmety biodiverzita Ochranná biológia inbreeding Populačná genetika abstraktné Cieľom programov ochrany je minimalizovať stratu genetickej diverzity, ktorá umožňuje populáciám prispôsobiť sa potenciálnym zmenám životného prostredia. To sa dá dosiahnuť vypočítaním toho, koľko potomkov by mal každý jednotlivec prispieť k ďalšej generácii, aby sa minimalizovalo globálne spolužitie. Nežiaducim dôsledkom tejto str

Dočasné zmeny vo frekvenciách alel, ale stabilná genetická diverzita za posledných tridsať rokov v populácii trnkovitých v Írsku, Raja clavata

Dočasné zmeny vo frekvenciách alel, ale stabilná genetická diverzita za posledných tridsať rokov v populácii trnkovitých v Írsku, Raja clavata

abstraktné Lúče a korčule sú nevyhnutnou súčasťou vedľajšieho úlovku pri rybolove pri dne. Za posledných 40 rokov sa trnkový lúč ( Raja clavata ) znížil av niektorých oblastiach dokonca zmizol, čo viedlo k obavám z genetického rizika. Z tohto dôvodu sa odhadovala efektívna veľkosť populácie ( N e ), miera migrácie ( m ) a časové zmeny v genetickej diverzite pre populáciu trnitých lúčov v Írskom mori a Bristolskom kanáli. Použitím genotypizovaných, archiv

Domestikácia kura: aktualizovaná perspektíva založená na mitochondriálnych genómoch

Domestikácia kura: aktualizovaná perspektíva založená na mitochondriálnych genómoch

predmety Genetická variácia Mitochondriálny genóm fylogenetický abstraktné Domáce kurčatá ( Gallus gallus domesticus ) plnia rôzne úlohy od jedla a zábavy po náboženstvo a zdobenie. Aby sme preskúmali jeho genetickú diverzitu a sledovali históriu domestikácie, skúmali sme celkom 4938 fragmentov mitochondriálnej DNA (mtDNA) vrátane 2843 predtým publikovaných a 2095 de novo jednotiek z 2044 domácich kurčiat a 51 červených jungleov ( Gallus gallus ). Na dosiahnutie najvyššej

Štruktúra populácie platesy obyčajnej (Platichthys flesus) v Baltskom mori: rozdiely medzi neresiteľnými a pelagickými neresiskami

Štruktúra populácie platesy obyčajnej (Platichthys flesus) v Baltskom mori: rozdiely medzi neresiteľnými a pelagickými neresiskami

abstraktné Zistili sme významnú štruktúru populácie a izoláciu podľa vzdialenosti medzi vzorkami platesy obyčajnej ( Platichthys flesus ) v Baltskom, Kattegatskom a Skagerrakovom mori pomocou mikrosatelitných genetických markerov. Tento vzor bol takmer úplne spôsobený rozdielom medzi platesy, ktoré majú neresenie pri dne v severnom Baltickom mori, v porovnaní s pelagickými neresnicami v južnom Baltskom mori a na západnom pobreží Švédska. Spomedzi rozmnožovačov

Odhad miery prekročenia na hierarchických úrovniach ovocia, jednotlivcov, populácií a druhov v Magnolia stellata

Odhad miery prekročenia na hierarchických úrovniach ovocia, jednotlivcov, populácií a druhov v Magnolia stellata

abstraktné V rastlinných druhoch so zmiešanými páriacimi systémami spôsobujú rozdiely v rôznych faktoroch - vrátane ich opeľovacieho systému, fenológie kvitnutia, formy života a náchylnosti na inbrídingovú depresiu - zmeny v miere prekračovania plodov u jednotlivcov, medzi jednotlivcami v rámci populácií a medzi populáciami v rámci druhov. Aby sme kvantifikoval

Genetická reinkarnácia pracovníkov ako kráľovien vo východnej medonosnej Apis cerana

Genetická reinkarnácia pracovníkov ako kráľovien vo východnej medonosnej Apis cerana

predmety Sociálny vývoj abstraktné Thelytokózna parenogenéza alebo asexuálna produkcia samíc potomstva je zriedkavá v živočíšnej ríši, ale v spoločenských hymenoptera je pomerne bežná. V prípade včiel je však známe, že je všadeprítomná v jednom poddruhu Apis mellifera , včela medonosnej, A. mellifera capensis . Tu u

Spekulácia sa spomaľuje v rozšírených a dlho žijúcich taxónoch stromov: poznatky z rodu Milicia (Moraceae) z tropického dreva.

Spekulácia sa spomaľuje v rozšírených a dlho žijúcich taxónoch stromov: poznatky z rodu Milicia (Moraceae) z tropického dreva.

predmety fylogenetika Rastlinná genetika speciácia abstraktné Dlhá doba generácie a veľká efektívna veľkosť rozšírených druhov lesných stromov môžu viesť k pomalému vývoju a neúplnému triedeniu línií, čo komplikuje vymedzenie druhov. Tento problém sme riešili s africkým drevom rodu Milicia, ktorý obsahuje dva morfologicky podobné a často zmätené druhy: M. excelsa , rozšírená od západne

Rekonštrukcia ohnísk chorôb z genetických údajov: grafový prístup

Rekonštrukcia ohnísk chorôb z genetických údajov: grafový prístup

predmety Epidiológia infekčných chorôb fylogenetika abstraktné Epidemiológia a plánovanie verejného zdravia sa budú stále viac spoliehať na analýzu údajov o genetických sekvenciách. Na rekonštrukciu priestorovo-časovej dynamiky patogénov počas ohnísk sa môžu použiť najmä genetické údaje spojené s dátumami a umiestneniami vzorkovaných izolátov. Doteraz sa na riešenie tohto

Multigeneračná hybridizácia a jej dôsledky na materské účinky atlantického lososa

Multigeneračná hybridizácia a jej dôsledky na materské účinky atlantického lososa

predmety Chov zvierat Genetická hybridizácia abstraktné Chov medzi segregujúcimi populáciami môže byť dôležitý z evolučného, ​​ochranárskeho a ekonomicko-poľnohospodárskeho hľadiska. Či a ako kríženie ovplyvňuje účinky na matku u voľne žijúcich populácií, sa zriedka študovalo, a to napriek výraznému vplyvu matky na prežitie predčasne narodených potomkov a známej prítomnosti účinkov na zdravie spôsobeným krížením v mnohých taxónoch. Študovali sme niekoľko znakov v štádiu kŕmenia

História plio-pleistocénu a fylogeografia Acacia senegal v suchých lesoch a savanách subsaharskej tropickej Afriky: dôkaz skorej kolonizácie a nedávneho rozšírenia rozsahu

História plio-pleistocénu a fylogeografia Acacia senegal v suchých lesoch a savanách subsaharskej tropickej Afriky: dôkaz skorej kolonizácie a nedávneho rozšírenia rozsahu

predmety Genetická variácia fylogenetika Rastlinná genetika abstraktné Suché oblasti sú rozsiahle v celej subsaharskej Afrike, sociálno-ekonomicky a ekologicky dôležité, ale vysoko citlivé na zmeny životného prostredia. Evolučné dejiny, ktoré odhalili súčasné intrašpecifické genetické variácie, môžu poskytnúť cenné informácie o tom, ako druhy reagovali na minulé zmeny v životnom prostredí a populácii, a usmerňujú stratégie na podporu odolnosti voči budúcim zmenám. Arabský strom žuvačky (Acacia senegal

Prepojenie transkriptomických a genomických variácií s rastom hybridov rodu Charr (Salvelinus fontinalis, Mitchill)

Prepojenie transkriptomických a genomických variácií s rastom hybridov rodu Charr (Salvelinus fontinalis, Mitchill)

predmety Genetická hybridizácia Genetická variácia Populačná genetika Transkriptomika abstraktné Hybridizácia môže viesť k fenotypovým rozdielom vyplývajúcim zo zmien v modeloch génovej expresie alebo nových kombináciách alel. Predpokladá sa, že variácia v génovej expresii je regulovaná rozdielmi v transkripčnej regulácii rodičovských alel, buď prostredníctvom cis- alebo trans- regulačných prvkov. Predchádzajúca štúdia medzi h

Stopy stredovekých migrácií v sociálne stratifikovanej populácii zo severného Talianska. Dôkazy od nezávislých ukazovateľov a hlboko zakorenených rodokmeňov

Stopy stredovekých migrácií v sociálne stratifikovanej populácii zo severného Talianska. Dôkazy od nezávislých ukazovateľov a hlboko zakorenených rodokmeňov

predmety Kultúrny vývoj Genetické markery Dynamika obyvateľstva Populačná genetika abstraktné Pri určovaní genetickej štruktúry Európy zohrávali rozhodujúcu úlohu sociálne a kultúrne faktory. Sociálne stratifikované populácie preto môžu pomôcť zamerať sa na konkrétne epizódy európskej demografickej histórie. V tejto štúdii používame ne

Rozdelenie jemnej štruktúry kmeňových prímesí v beduínskej populácii pomocou genomických údajov

Rozdelenie jemnej štruktúry kmeňových prímesí v beduínskej populácii pomocou genomických údajov

predmety Populačná genetika abstraktné Izraelská beduínska populácia je vysoko inbredná a štruktúrovaná s veľmi vysokou prevahou recesívnych chorôb. Mnohé štúdie za posledné dve desaťročia sa zameriavali na analýzu väzieb u veľkých, viacnásobných rodokmenov tejto populácie. Nástup vysokovýkonných technológií motivoval vedcov k tomu, aby hľadali zriedkavé varianty zdieľané medzi menšími rodokmeňmi a integrovali údaje z klinicky podobných, ale zdanlivo nesúvisiacich sporadických prípadov. Takéto analýzy sú však náročné, pretože b

Je homoploidná hybridná špekulácia taká zriedkavá? Empiricistický pohľad

Je homoploidná hybridná špekulácia taká zriedkavá? Empiricistický pohľad

predmety vývoj Evolučná teória fylogenetika Prírodná hybridizácia a jej úloha v evolúcii a osobitne pri vytváraní novej diverzity je starou a napriek tomu nekonečne revitalizovanou témou (Lotsy, 1916; Anderson, 1949; Stebbins, 1959; Rieseberg a kol., 2003; Mallet, 2007; Soltis a Soltis, 2009). Larsen a ko

Genetická štruktúra základného druhu: škálovanie spoločenských fenotypov od jednotlivca po región

Genetická štruktúra základného druhu: škálovanie spoločenských fenotypov od jednotlivca po región

abstraktné Pochopenie miestnych a regionálnych modelov distribúcie druhov bolo hlavným cieľom ekologického a vývojového výskumu. Predstava, že tieto vzorce je možné pochopiť pomocou jednoduchých kvantitatívnych pravidiel, je atraktívna, ale hoci existuje mnoho zákonov týkajúcich sa škálovania (napr. Metabolických, frak

Genetická diverzita a pokles toku génov so zvýšením horských podeniek

Genetická diverzita a pokles toku génov so zvýšením horských podeniek

predmety Ekologická genetika Populačná genetika abstraktné Montane prostredie po celom svete sú „hotspoty“ biodiverzity a dôležité zdroje genetickej diverzity. Druhy Montane sú tiež zvyčajne zraniteľnejšie voči zmenám životného prostredia ako ich náprotivky s nízkou nadmorskou výškou kvôli obmedzeným rozsahom a obmedzeniam šírenia. Zameriavame sa na dva hojné

Genetické a fenotypové vplyvy na prežívanie kopulačnej zátky u myší

Genetické a fenotypové vplyvy na prežívanie kopulačnej zátky u myší

predmety Evolučná biológia abstraktné U rôznych zvierat koaguluje samčia semenná tekutina po ejakulácii za vzniku kalenej štruktúry známej ako kopulačná zátka. Predchádzajúce štúdie naznačujú, že kopulačné sviečky sa vyvinuli ako mechanizmus pre mužov, aby bránili rematácii u žien, ale chýba podrobné vyšetrenie týkajúce sa časového priebehu, počas ktorého tieto sviečky prežívajú v reprodukčnom trakte ženy. Tu krížime samcov z ôsmich inbredných kme

Génové interakcie obmedzujú priebeh vývoja rezistencie na fosfíny u vrtákov s menším zrnom, Rhyzopertha dominica

Génové interakcie obmedzujú priebeh vývoja rezistencie na fosfíny u vrtákov s menším zrnom, Rhyzopertha dominica

abstraktné Fosfín, bežne používaný fumigant na ochranu skladovaného zrna pred škodcami hmyzu, nepriamo ničí organizmy tým, že vyvoláva oxidačný stres. V Ázii, Austrálii a Južnej Amerike sa zistila vysoká dedičná rezistencia voči fosfínu u hmyzích škodcov skladovaných zŕn. Aby sme pochopili vývoj rezistencie na fosfín a izolovali zodpovedné gény, uskutočnili sme analýzu genetických väzieb plne citlivých (QRD14), stredne rezistentných (QRD369) a vysoko rezistentných (QRD569) kmeňov R. dominica získaných v Austrálii. Už sm

Krátkodobé genetické dôsledky straty biotopu a fragmentácie na neotropickú dlaň Oenocarpus bataua

Krátkodobé genetické dôsledky straty biotopu a fragmentácie na neotropickú dlaň Oenocarpus bataua

predmety Štrukturálne variácie abstraktné Strata a fragmentácia biotopu môže mať vplyv na rozptyl semien a peľu sprostredkovaný živočíchmi. Kľúčovou otázkou je, ako genetické atribúty populácií rastlín reagujú na tieto zmeny. Teória predpovedá, že genetická diverzita môže byť na takéto narušenia v krátkodobom horizonte menej citlivá, zatiaľ čo šľachtenie a genetická štruktúra môžu reagovať silnejšie. Výsledky doterajších štúdií sa však líšia v

Genómia faktorov nezlučiteľnosti a stanovenie pohlavia pri hybridizujúcich druhoch druhu Cottus (Ryby)

Genómia faktorov nezlučiteľnosti a stanovenie pohlavia pri hybridizujúcich druhoch druhu Cottus (Ryby)

predmety Genomics Populačná genetika abstraktné Cottus rhenanus a Cottus perifretum vytvorili hybridné línie a úzke hybridné zóny, ktoré možno najlepšie vysvetliť pôsobením prírodného výberu. Základné selektívne sily, ako aj ich genomické ciele však nie sú dobre známe. Táto štúdia identifikuje genómové oblasti u rodičovských druhov, ktoré spôsobujú hybridné inkompatibility, a testuje, či sa tieto prejavujú v závislosti od pohlavia, aby sa dozvedeli o procesoch, ktoré ovplyvňujú prirodzenú hybridizáciu v Cottus . Interšpecifické kríženia F2 sa analyzoval

Reakcia na výber a realizovaná dedičnosť dĺžky spermií u žltého trusu (Scathophaga stercoraria)

Reakcia na výber a realizovaná dedičnosť dĺžky spermií u žltého trusu (Scathophaga stercoraria)

abstraktné Dĺžka spermy vykazuje značné fenotypové variácie inter- aj intra-špecificky, ale všeobecné vysvetlenie tejto variácie chýba. Naše chápanie genetickej variácie, z ktorej vychádzajú variácie dĺžky spermií, je tiež obmedzené, pretože sa vykonalo len málo štúdií o genetike veľkosti spermií. Jedným z faktorov, ktorý by

Zlepšenie zásob alebo morský ranč? Informácie z monitorovania genetickej diverzity, príbuznosti a efektívnej veľkosti populácie v očkovanej populácii veľkého skalpu (Pecten maximus)

Zlepšenie zásob alebo morský ranč? Informácie z monitorovania genetickej diverzity, príbuznosti a efektívnej veľkosti populácie v očkovanej populácii veľkého skalpu (Pecten maximus)

predmety biodiverzita Populačná genetika abstraktné Hromadné vypustenie populácií rozmnožovaných v liahni vyvoláva početné otázky týkajúce sa jeho účinnosti z hľadiska miestneho náboru a vplyvu na genetickú diverzitu voľne žijúcich populácií. Na začiatku osemdesiatych rokov v zátoke Brest (Francúzsko) sa na začiatku osemdesiatych rokov začal program očkovania pozostávajúci z hromadného uvoľňovania mláďat produkovaných liahňou v miestnej prirodzene sa vyskytujúcej populácii veľkých lastúrnikov ( Pecten maximus L.). Cieľom tejto štúdie je vyhodnotiť, či te

Transkripcia heterochromatických génov 5S rRNA je epigeneticky kontrolovaná v Arabidopsis thaliana a Xenopus laevis

Transkripcia heterochromatických génov 5S rRNA je epigeneticky kontrolovaná v Arabidopsis thaliana a Xenopus laevis

abstraktné 5S ribozomálna DNA je vysoko konzervovaná tandemovo sa opakujúca multigénna rodina. Ako sa navrhuje už dlhší čas, ukázali sme, že iba časť génov 5S rRNA sa exprimuje v Arabidopsis thaliana. V prípade Xenopus laevis existuje vývojová kontrola expresie génov 5S rRNA s iba jednou z dvoch rodín 5S rDNA exprimovaných počas oogenézy. Pri Arabidopsis a Xe

Predstavujú morské ježovky chované v liahni hrozbu pre genetickú diverzitu voľne žijúcich populácií?

Predstavujú morské ježovky chované v liahni hrozbu pre genetickú diverzitu voľne žijúcich populácií?

predmety Chov zvierat Populačná genetika abstraktné U lososovitých sa ukázalo, že uvoľnenie rýb chovaných v liahni má nezvratné genetické účinky na voľne žijúce populácie. Napriek tomu, že zodpovedné postupy pri produkcii a uvoľňovaní geneticky rôznorodých mláďat chovaných v liahni boli publikované vo veľkom rozsahu, implementujú sa zriedka. Tu sme skúmali genetické rozd

Účinky disperznej plasticity na divergenciu a špekuláciu obyvateľstva

Účinky disperznej plasticity na divergenciu a špekuláciu obyvateľstva

predmety Evolučná teória Štrukturálne variácie abstraktné Predpokladá sa, že fenotypová plasticita zohráva úlohu pri budovaní populácie, miestnom prispôsobovaní a špekuláciách. V tejto literatúre sa však nedocenila disperzná plasticita. Plasticita v rozhodnutí o disperzii je taxonomicky rozšírená a uvádzam príklady hmyzu, mäkkýšov, polychaetov, stavovcov a kvitnúcich rastlín. Teoretická práca je obmedzená,

Negatívne fenotypové a genetické súvislosti medzi trvaním kopulácie a dlhovekosťou samcov chrobákov

Negatívne fenotypové a genetické súvislosti medzi trvaním kopulácie a dlhovekosťou samcov chrobákov

predmety Štúdium genetickej asociácie Modelové bezstavovce Sexuálne správanie Pôvodný článok bol uverejnený 29. júla 2009 Oprava : Dedičnosť (2009) 103, 340–345; doi: 10, 1038 / hdy.2009.80 Autori objavili chybu, ktorú by chceli napraviť. Tabuľka 1 ukazuje nesprávne hodnoty pre koeficienty aditívnej genetickej variácie (CV A ). Správne hodnoty sú n

Krížová depresia v mestskom prostredí huby vtáčieho hniezda Cyathus stercoreus (Nidulariaceae: Basidiomycota)

Krížová depresia v mestskom prostredí huby vtáčieho hniezda Cyathus stercoreus (Nidulariaceae: Basidiomycota)

predmety huby inbreeding Populačná genetika abstraktné Mnoho organizmov vykazuje kodispersal potomstva, ale menej zobrazuje kodispersal kompatibilných gamét. Tento mechanizmus zvyšuje schopnosť druhov kolonizovať po rozptýlení na veľké vzdialenosti ako mechanizmus reprodukčnej istoty, ale tiež podporuje kríženie a potenciálne zníženie telesnej zdatnosti. Skúmali sme tu ro

Účinnosť genómovej selekcie pri navrhovaní šľachtiteľskej populácie a predikcii fenotypu v rajčiakoch

Účinnosť genómovej selekcie pri navrhovaní šľachtiteľskej populácie a predikcii fenotypu v rajčiakoch

predmety Poľnohospodárska genetika Rozmnožovanie rastlín Rastlinná genetika abstraktné Genomický výber (GS), ktorý využíva odhadovaný genetický potenciál založený na údajoch o genotype pre celý genóm pre šľachtiteľský výber, sa v súčasnosti všeobecne prijíma ako účinná metóda na zlepšenie geneticky komplexných znakov. Hodnotili sme potenciál GS na zv

Evolučná a ekologická funkčná genomika

Evolučná a ekologická funkčná genomika

Genomika, proteomika a súvisiace technológie objavujú pozoruhodné variácie génov a ich expresie, ale tieto objavy sú iba začiatkom. Ďalším krokom je zistenie, ako táto zmena ovplyvňuje funkciu a vhodnosť celých organizmov v populáciách. Popri etablovaných spoločenstvách v biomedicínskej a poľnohospodárskej funkčnej genomike sa vytvorila nová komunita: evolučná a ekologická funkčná genomika (EEFG), ktorá sa snaží pochopiť funkčný základ evolučných síl formujúcich ekologicky dôležité znaky v prirodzených biologických spoločenstvách. Vyžaduje si to objasnenie fungovania biotickýc

Pochopenie nedávnej kolonizačnej histórie rastlinnej patogénnej huby s použitím populačných genetických nástrojov a približného bayesovského výpočtu

Pochopenie nedávnej kolonizačnej histórie rastlinnej patogénnej huby s použitím populačných genetických nástrojov a približného bayesovského výpočtu

predmety Plesňová biológia Plesňová patogenéza Populačná genetika abstraktné Pochopenie procesov zavádzania nových chorôb do predtým zdravých oblastí je hlavným záujmom pri vypracovávaní politík prevencie a riadenia, ako aj pri porozumení dynamiky diverzity patogénov vo veľkom priestorovom meradle. V tejto štúdii sme sa

Transkripčný podpis hybridného rozkladu spojeného s vnútornou reprodukčnou izoláciou v dvojiciach druhov molíc jazerných (Coregonus spp. Salmonidae)

Transkripčný podpis hybridného rozkladu spojeného s vnútornou reprodukčnou izoláciou v dvojiciach druhov molíc jazerných (Coregonus spp. Salmonidae)

predmety Vývojová biológia Génová regulácia Modelové stavovce speciácia abstraktné Genetické analýzy špekulácie sa takmer výlučne zameriavali na retrospektívne analýzy reprodukčnej izolácie medzi vysoko divergentnými druhmi. Úplné porozumenie procesu špekulácie však musí zahŕňať analýzu dôsledkov genomickej divergencie v mladých líniách, ktoré sú stále schopné vymieňať gény v prírodných podmienkach. Hromadenie podmienečne neutrálnej genetic

Zaťaženie plemenitby a čistenie: dôsledky pre krátkodobé prežitie a riadenie zachovania malých populácií

Zaťaženie plemenitby a čistenie: dôsledky pre krátkodobé prežitie a riadenie zachovania malých populácií

predmety inbreeding Populačná genetika abstraktné Pomocou počítačových simulácií vyhodnotíme účinky genetického čistenia inbreedingovej záťaže v malých populáciách a predpokladáme genetické modely škodlivých mutácií, ktoré zodpovedajú empiricky pozorovanému typickému zaťaženiu. Naše výsledky ukazujú, že gene

Ontogenetické zmeny v genetických variantoch plasticity závislej od veku pozdĺž latentného gradientu

Ontogenetické zmeny v genetických variantoch plasticity závislej od veku pozdĺž latentného gradientu

predmety Evolučná genetika abstraktné Expresia fenotypovej plasticity sa môže líšiť medzi životnými štádiami toho istého organizmu. Vekovo závislá plasticita môže byť dôležitá pre prispôsobenie sa heterogénnemu prostrediu, toto sa však len nedávno uznalo. Či je plasticita závislá od veku spoločným výsledkom miestnej adaptácie a či populácie v tejto súvislosti nesú genetické rozdiely, zostáva do značnej miery neznáma. Na zodpovedanie týchto otázok sme odha

Relatívne účinky segregácie a rekombinácie na vývoj pohlavia v konečných diploidných populáciách

Relatívne účinky segregácie a rekombinácie na vývoj pohlavia v konečných diploidných populáciách

predmety Evolučná genetika abstraktné Mechanizmus reprodukcie životaschopnejších potomkov v reakcii na výber je hlavným faktorom ovplyvňujúcim výhody pohlavia. V diploidoch sexuálna reprodukcia kombinuje genotyp pomocou rekombinácie a segregácie. Teoretické štúdie sexuálnej reprodukcie skúmali výhodu rekombinácie v haploidoch. Potenciálna výhoda

Predpovedanie výkonnosti hybridnej ryže s použitím univariačných a multivariačných modelov GBLUP založených na párení v Severnej Karolíne II

Predpovedanie výkonnosti hybridnej ryže s použitím univariačných a multivariačných modelov GBLUP založených na párení v Severnej Karolíne II

predmety Rozmnožovanie rastlín abstraktné Genomická selekcia (GS) je pri hybridnom šľachtení účinnejšia ako tradičné metódy založené na fenotypoch. Táto štúdia skúmala predikčnú schopnosť genomických najlepších lineárnych nestranných predikčných modelov pre hybridy ryže na základe spôsobu párenia v Severnej Karolíne II, v ktorom bolo celkom 115 krížencov ryže inbredných krížených s 5 mužskými sterilnými líniami. Použitím 8 znakov z 575 (115 × 5) hybridov

Inferencia viacvlnovej prímesovej populácie modelovaním úpadku väzbovej nerovnováhy s polynómovými funkciami

Inferencia viacvlnovej prímesovej populácie modelovaním úpadku väzbovej nerovnováhy s polynómovými funkciami

predmety Populačná genetika abstraktné Na odvodenie histórie populačnej prímesi je jednou z dôležitých výziev pri metódach založených na nerovnováhe spojovacích väzieb prímesí (ALD) odstránenie efektu zdrojového LD (SLD), ktorý sa priamo dedí zo zdrojových populácií. V predchádzajúcich metódach bola na zistenie nedávnej jedno- alebo viacvlnovej prímesi osadená iba rozkladová krivka váženej LD medzi pármi miest, ktorých genetická vzdialenosť bola väčšia ako určitá počiatočná vzdialenosť. Účinok SLD však nebol dobre definovaný a nebo

Zhlukovanie populácie a klonálna štruktúra svedčia o reliktnom stave Ulmus minor Mill. na Baleárskych ostrovoch

Zhlukovanie populácie a klonálna štruktúra svedčia o reliktnom stave Ulmus minor Mill. na Baleárskych ostrovoch

predmety Ochranná biológia Ekológia rastlín Populačná genetika abstraktné Polný lom ( Ulmus minor ) je breh rieky, ktorý rastie v zriedkavých malých populáciách roztrúsených po dočasných vodných tokoch na Baleárskych ostrovoch, ktoré sú dnes väčšinou pokryté stredomorskou vegetáciou. Poľnohospodárstvo a poľn

Posúdenie spoľahlivosti kvantitatívnych genetických odhadov v študijných systémoch s vysokou mierou reprodukcie extra párov a nízkym náborom

Posúdenie spoľahlivosti kvantitatívnych genetických odhadov v študijných systémoch s vysokou mierou reprodukcie extra párov a nízkym náborom

predmety Evolučná genetika abstraktné Kvantitatívne genetické prístupy, a najmä živočíšne modely, sa široko používajú na hodnotenie genetickej (ko) variácie kľúčových vlastností týkajúcich sa fitnes a odvodenia adaptačného potenciálu voľne žijúcich populácií. Napriek dôležitosti presnosti a presnosti odhadov genetickej odchýlky a ich potenciálnej citlivosti na rôzne ekologické a populačne špecifické faktory sa ich spoľahlivosť zriedka výslovne testuje. Tu sme použili simulácie a empirické údaj

Mapovanie genetických lokusov, ktoré interagujú s myostatínom, aby ovplyvnili rastové vlastnosti

Mapovanie genetických lokusov, ktoré interagujú s myostatínom, aby ovplyvnili rastové vlastnosti

predmety Genetické mapovanie Kvantitatívne znaky loci abstraktné Myostatín alebo GDF8 je inhibítor rastu kostrových svalov. Nefunkčná mutácia myostatínu vedie k dvojitému svalovému fenotypu u niektorých druhov, napríklad u myší, hovädzieho dobytka a ľudí. Predchádzajúce štúdie naznačili, že v genóme existujú lokusy, ktoré interagujú s myostatínom na kontrolu hĺbky zadného tuku a ďalších komplexných znakov. Teraz uvádzame štúdiu mapovania kv

Ostrovy špekulácie alebo zázrakov na púšti? Preskúmanie úlohy obmedzenej rekombinácie pri udržiavaní druhov

Ostrovy špekulácie alebo zázrakov na púšti? Preskúmanie úlohy obmedzenej rekombinácie pri udržiavaní druhov

predmety DNA rekombinácia speciácia Pôvodný článok bol uverejnený 18. novembra 2009 Oprava: Dedičnosť (2009) 103 , 434–444; doi: 10, 1038 / hdy2009.151 Od uverejnenia tohto článku autori zaznamenali, že do citácie Turner et al. (2005) na strane 440 a potom na strane 441 „každá z vyššie uvedených empirických štúdií špecificky dokumentovala tento model aspoň čiastočne pomocou relatívnych divergenčných opatrení, ako sú F ST a Da a interpretovaná v kontexte regiónov s nízkou rekombináciou uľahčujúcich druhová divergencia v prítomnosti toku génov. ““ Turner a kol. (2005) štúdia použila inú

Komponenty genetickej variácie a dedičnosť multialelickej heterozygozity pri inbrídingu

Komponenty genetickej variácie a dedičnosť multialelickej heterozygozity pri inbrídingu

predmety Evolučná genetika abstraktné Udržiavanie genetickej diverzity vo vlastnostiach súvisiacich s fyzickou zdatnosťou zostáva ústrednou témou evolučnej biológie, napríklad v súvislosti so sexuálnym výberom kvôli genetickým výhodám. Medzi riešeniami, ktoré boli navrhnuté, je smerový sexuálny výber pre heterozygotnosť. O dôležitosti takéhoto v

Reprodukčná aktivita spúšťa zrýchlenú úmrtnosť mužov a znižuje životnosť: determinanty genetickej a génovej expresie v Drosophile

Reprodukčná aktivita spúšťa zrýchlenú úmrtnosť mužov a znižuje životnosť: determinanty genetickej a génovej expresie v Drosophile

predmety Evolučná genetika genetika abstraktné Reprodukcia a starnutie sa vyvinuli tak, aby boli úzko spojené. Experimentálny výber pre reprodukciu v ranom veku vedie k vývoju zníženej dlhovekosti v Drosophile, zatiaľ čo experimentálny výber pre zvýšenú dlhovekosť vedie k zmenám v reprodukcii. Aj keď teória dej

Chovná depresia v dvojdomých populáciách rastlín Mercurialis annua: porovnania medzi kríženými potomkami a potomkami samooplodených feminizovaných samcov

Chovná depresia v dvojdomých populáciách rastlín Mercurialis annua: porovnania medzi kríženými potomkami a potomkami samooplodených feminizovaných samcov

abstraktné Chovateľská depresia je kľúčovým faktorom udržiavania samostatných pohlaví v rastlinách výberom, aby sa zabránilo samooplodneniu. O úrovniach inbreedingovej depresie u dvojdomých druhov je však známe len veľmi málo, samozrejme preto, že je ťažké samooplodniť samcov alebo samice. Tento problém sme prek

Aký tuk je chvost?

Aký tuk je chvost?

Disperzia semien a peľu sú kľúčové parametre pri formovaní dynamiky a vývoja rastlinných populácií, pretože ovplyvňujú kolonizačné procesy a genetické výmeny medzi jednotlivcami. Naše znalosti rozsahu vzdialeností prekračovaných semenami alebo peľom sa za posledné dve desaťročia výrazne zlepšili použitím vysoko polymorfných molekulárnych markerov, ako sú mikrosatelity (Smouse and Sork, 2004). Na základe porovnania genotypov

Viacnásobné zavádzanie odlišných genetických línií do invazívneho hubového patogénu, Cryphonectria parasitica, vo Francúzsku

Viacnásobné zavádzanie odlišných genetických línií do invazívneho hubového patogénu, Cryphonectria parasitica, vo Francúzsku

abstraktné Výskyt viacnásobných introdukcií môže byť rozhodujúcim faktorom úspešného založenia inváznych druhov, ale len málo štúdií sa zameriava na introdukciu hubových patogénov napriek ich významnému vplyvu na napadnuté biotopy. Hoci huba gaštanová Cryphonectria parasitica , ktorá sa v 20. storočí vyskytla v Sever

Evolučná štúdia potenciálneho selekčného cieľového regiónu ošípaných

Evolučná štúdia potenciálneho selekčného cieľového regiónu ošípaných

predmety Genetická variácia Modelové stavovce Molekulárny vývoj Kvantitatívne znaky loci abstraktné Domestikácia, moderné šľachtenie a umelý výber dramaticky formovali genomickú variabilitu domácich zvierat. U hovädzieho dobytka bol tzv. Kvantitatívny znak FAT1 (QTL) v prasačom chromozóme 4 prvým QTL odkrytým, hoci jeho presná molekulárna povaha sa doteraz nepolapila. Tu charakterizujeme n

Odhad súčasnej efektívnej veľkosti populácie nemodelných druhov pomocou nerovnováhy spojenia medzi tisíckami lokusov

Odhad súčasnej efektívnej veľkosti populácie nemodelných druhov pomocou nerovnováhy spojenia medzi tisíckami lokusov

predmety Genetická variácia Genomics Populačná genetika abstraktné Súčasná efektívna veľkosť populácie ( N e ) sa dá odhadnúť pomocou nerovnováhy spojenia (LD) pozorovanej naprieč pármi lokusov, o ktorých sa predpokladá, že sú selektívne neutrálne a neprepojené. Táto metóda sa bežne používa v súboroch údajov obsahujúcich 10 - 100 lokusov na informovanie o ochrane a štúdiu demografie populácie. Výkonnosť týchto odhadov by sa moh

Fylogeografické dôkazy o dvoch mesických refúgiách v hotspote biodiverzity

Fylogeografické dôkazy o dvoch mesických refúgiách v hotspote biodiverzity

predmety biodiverzita biogeography Rastlinná genetika Populačná genetika abstraktné Fylogeografické štúdie flóry v juhozápadnej Austrálii bohatej na druhy poukazujú na zložité vývojové histórie, ktoré odrážajú vzorce perzistencie a odolnosti voči klimatickým zmenám počas pleistocénu. Pýtali sme sa, či pobre

Adaptívna divergencia v prostredí s vysokým tokom génov: variácia hsc70 európskej platesy obyčajnej (Platichthys flesus L.)

Adaptívna divergencia v prostredí s vysokým tokom génov: variácia hsc70 európskej platesy obyčajnej (Platichthys flesus L.)

abstraktné O miestnych adaptáciách v morských rybách je známe málo, pretože populačné genetické prieskumy u týchto druhov zvyčajne neuplatňujú genetické markery podliehajúce selekcii. V tejto štúdii sme použili kandidátsky génový prístup na skúmanie adaptačnej divergencie populácie platesy európskej ( Platichthys flesus L.) v severovýchodnom Atlanti

Inbredné zdobené cvrčky vykazujú vyššiu mieru makroparazitickej imunity ako u jedincov s krížením

Inbredné zdobené cvrčky vykazujú vyššiu mieru makroparazitickej imunity ako u jedincov s krížením

predmety genetika imunológie inbreeding abstraktné Predpokladá sa, že šľachtenie má negatívny vplyv na kondíciu vrátane zníženej schopnosti odolávať imunitným problémom. Skúmali sme imunologické následky kríženia u ozdobených cvrčkov, Gryllodes sigillatus , porovnaním lytickej aktivity, fenoloxidázovej (PO) aktivity a enkapsulačnej schopnosti cvrčkov z ôsmich inbredných línií so schopnosťami cvrčkov z vyššej populácie zakladateľov. Prekvapivo, cvrčky z inbredných lín

Použitie viacerých markerov demonštruje kryptické západné refúgium a postglaciálne trasy kolonizácie lososa atlantického (Salmo salar L.) v severozápadnej Európe.

Použitie viacerých markerov demonštruje kryptické západné refúgium a postglaciálne trasy kolonizácie lososa atlantického (Salmo salar L.) v severozápadnej Európe.

predmety Genetické markery Genetická variácia abstraktné Ľadové a postglaciálne procesy sú známe ako dôležité determinanty štruktúrovania súčasnej populácie pre mnoho druhov. V Európe sa za hlavné zdroje druhov kolonizujúcich severnú Európu po ľadovcovom ústupe považuje refugia na talianskom, balkánskom a Pyrenejskom polostrove. Stále však existujú dôka

Nedostatky heterozygotov v populáciách parazitov: vyhodnotenie vzájomne prepojených hypotéz v kliešte medvedíkov, Ixodes texanus

Nedostatky heterozygotov v populáciách parazitov: vyhodnotenie vzájomne prepojených hypotéz v kliešte medvedíkov, Ixodes texanus

predmety Modelové bezstavovce Biológia parazitov Populačná genetika abstraktné Populačná genetika sa čoraz viac používa na štúdium biológie parazitov na stupnici hostiteľa (infrapopulácia, IP) a hostiteľskej populácie (populácia komponentov, CP). V tejto štúdii sme testovali tri mechanistické hypotézy, ktoré by mohli vysvetliť odchýlky od očakávaní Hardyho-Weinbergovej rovnováhy (HWE) v dôsledku deficitu heterozygotov (HD) na stupnici CP v kliešťoch mývalov ( Ixodes texanus ; n = 718) získaných z mývalov ( Procyon lotor ; n = 91) a genotypizované v 11 mikrosatelitných lokusoch. Týmito hypotézam

Genomická imprinting: teórie a údaje

Genomická imprinting: teórie a údaje

predmety vtlačení William Bateson, jeden z otcov Mendelovej genetiky, vo svojej úvodnej profesijnej prednáške v Cambridge napomenul študentov novej vedy: Ak by som mohol vyhodiť slovo pre začiatočníkov, je to: Pokladajte svoje výnimky! , Uchovávajte ich vždy odkryté a na dohľad. Výnimky sú ako hrubá tehla rastúcej budovy, ktorá hovorí, že je treba prísť viac a ukazuje, kde bude ďalšia stavba. (Bateson, 1908) Táto rad

Zmeny vo vlastnostiach spojených s fitness v dôsledku skladania rezistencie na transgénny glyfosát a odolnosti proti hmyzu v Brassica napus L.

Zmeny vo vlastnostiach spojených s fitness v dôsledku skladania rezistencie na transgénny glyfosát a odolnosti proti hmyzu v Brassica napus L.

predmety Poľnohospodárska genetika Ekológia rastlín Reakcie na stres rastlín abstraktné Stále viac sa vyvíja geneticky modifikované plodiny na vyjadrenie viacerých „naskladaných“ znakov pre rôzne typy transgénov, napríklad odolnosť voči herbicídom, odolnosť proti hmyzu, kvalita plodín a tolerancia voči environmentálnym stresom. Uvoľnenie plodín, ktoré

Sekvenovanie celého genómu nemodelových organizmov: poučenie z nezmapovaných údajov

Sekvenovanie celého genómu nemodelových organizmov: poučenie z nezmapovaných údajov

predmety Genetické mapovanie Sekvenovanie novej generácie Rastlinná genetika abstraktné Nemapované údaje sa často vyraďujú z analýzy opakovaného sekvencovania celého genómu, ale prostredníctvom ich analýzy sa môžu odhaliť nové biologické informácie a poznatky. V tomto článku skúmame nezmapované čítania z údajov o opakovanom sekvenovaní 33 genómov hrachovej mšice od jedincov špecializovaných na rôzne hostiteľské rastliny. Nemapované odčítania pre každého j

Zvýšená inbrídzia a silná príbuzenská štruktúra v Taxus baccata odhadovaná z údajov AFLP aj SSR

Zvýšená inbrídzia a silná príbuzenská štruktúra v Taxus baccata odhadovaná z údajov AFLP aj SSR

predmety inbreeding Prirodzené variácie rastlín Populačná genetika abstraktné Fragmentácia biotopu môže mať na stromy vážne genetické následky, ako napríklad zvýšený kríženec a znížená efektívna veľkosť populácie. Miestne populácie v skutočnosti trpia znížením genetickej variácie, a teda stratou adaptačnej kapacity, čo následne zvyšuje riziko vyhynutia. V Európe patrí Taxus baccata medzi

Efektívna veľkosť populácie v ekológii a evolúcii

Efektívna veľkosť populácie v ekológii a evolúcii

predmety Evolučná teória Dynamika obyvateľstva Populačná genetika Efektívna veľkosť populácie ( N e ) je jedným z najdôležitejších parametrov v populačnej genetike a biologii ochrany. Premieňa sčítanie ľudu na skutočnú populáciu na veľkosť idealizovanej populácie, ktorá vykazuje rovnakú mieru straty genetickej diverzity ako skúmaná skutočná populácia. Je možné rozlíšiť niekoľko konc

Fylogeografický vzorec rozšírenia rozsahu poskytuje dôkazy o kryptických druhoch rodu Silene nutans v západnej Európe

Fylogeografický vzorec rozšírenia rozsahu poskytuje dôkazy o kryptických druhoch rodu Silene nutans v západnej Európe

predmety ekológia Populačná genetika abstraktné V dôsledku nedávnych alebo minulých evolučných procesov by sa jeden druh mohol skladať z odlišných vývojových významných jednotiek (ESU), dokonca zodpovedajúcich kryptickým druhom. Určenie základných mechanizmov posunov rozsahu a procesov, ktoré sa pracujú pri vytváraní odlišných ESU, si vyžaduje objasnenie faktorov, ktoré prispievajú k genetickej divergencii populácie v celom rozsahu druhov. Preskúmali sme rozsiahle vzor

Chromozómová spojovacia nerovnováha spôsobená inverzným polymorfizmom vrabca bieleho (Zonotrichia albicollis)

Chromozómová spojovacia nerovnováha spôsobená inverzným polymorfizmom vrabca bieleho (Zonotrichia albicollis)

predmety Genetická variácia Modelové stavovce Molekulárny vývoj abstraktné Chromozomálne inverzie sú pre genetikov dlhodobým záujmom, pretože sú schopné potlačiť rekombináciu a uľahčiť tvorbu adaptívnych génových komplexov. Výnimočný inverzný polymorfizmus (ZAL2 m ) vrabca bielohorého ( Zonotrichia albicollis ) súvisí s variáciou peria, sociálneho správania a výberu matiek a v populácii je udržiavaný negatívnym kombinovaným párením. Polymorfizmus ZAL2 m je komplexnou inv

Dynamika populácie a rýchle rozšírenie Cardinium, bakteriálneho endosymbiontu, ktorý spôsobuje cytoplazmatickú nekompatibilitu v Encarsia pergandiella (Hymenoptera: Aphelinidae)

Dynamika populácie a rýchle rozšírenie Cardinium, bakteriálneho endosymbiontu, ktorý spôsobuje cytoplazmatickú nekompatibilitu v Encarsia pergandiella (Hymenoptera: Aphelinidae)

abstraktné Cytoplazmatická nekompatibilita (CI) je bežný fenotyp materských dedičných bakteriálnych symbiontov článkonožcov; vo svojom najjednoduchšom vyjadrení neinfikované samice produkujú málo alebo žiadne životaschopné potomstvo, keď sa spárujú s infikovanými samcami. Infikované ženy tak zažívajú reprodukčnú výhodu v porovnaní s neinfikovanými ženami, s možnosťou, že sa symbiont rýchlo rozšíri. Predpokladá sa, že dynamika populácie

Transpozovateľné prvky v zárodočnej línii cicavcov: pohodlný výklenok alebo smrtiaca pasca?

Transpozovateľné prvky v zárodočnej línii cicavcov: pohodlný výklenok alebo smrtiaca pasca?

predmety Metylácia DNA DNA transponovateľné prvky Hlavný vývoj RNA Piwi abstraktné Retrotransponovateľné prvky tvoria okolo 50% cicavčieho genómu. Ich aktivita predstavuje pre hostiteľa neustále ohrozenie a podnietila vývoj adaptívnych kontrolných mechanizmov na ochranu architektúry a funkcie genómu. Aby sa zabezpeč

Poľnohospodári bez hraníc - genetická štruktúra jačmeňa v storočí (Hordeum vulgare)

Poľnohospodári bez hraníc - genetická štruktúra jačmeňa v storočí (Hordeum vulgare)

predmety Poľnohospodárska genetika biogeography Populačná genetika abstraktné Geografické rozšírenie genetickej diverzity môže odhaliť evolučnú históriu druhu. V prípade kultúrnych rastlín fylogeografické vzorce tiež naznačujú, ako sa semená vymieňajú a šíria v agrárnych komunitách. Takéto vzorce sú však ľahk