Chemická biológia (Apríl 2020)

Alosterická inhibícia hypoxiou indukovateľného faktora-2 s malými molekulami

Alosterická inhibícia hypoxiou indukovateľného faktora-2 s malými molekulami

predmety biochémie biofyzika rakovina Chemické náradie Vysoko výkonný skríning Malé molekuly abstraktné Faktory indukovateľné hypoxiou (HIF) sú heterodimérne transkripčné faktory indukované pri mnohých rakovinách, kde často podporujú expresiu protumorigénnych dráh. Aj keď sú transkripčné faktory typicky považované za „neaglutovateľné“, doména PAS-B podjednotky HIF-2a obsahuje vo svojom hydrofóbnom jadre veľkú dutinu, ktorá ponúka jedinečnú oporu pre reguláciu malých molekúl. Tu identifikujeme umelé ligandy, ktoré sa

Chirálna cykloadícia

Chirálna cykloadícia

predmety Reakčné mechanizmy Chemická syntéza Angew. Chem. Int. Ed. 51 , 1248 - 12151 (2012) Domino reakcie poskytujú jednoduchý prístup k zložitým molekulárnym architektúram, často s vynikajúcou stereochemickou kontrolou. Shi a kol . poskytujú elegantný príklad tohto prístupu v novej [2 + 2 + 2] cykloadičnej reakcii kombinujúcej Michael a Henryho reakcie, aby sa získal prístup k cyklohexánovému produktu so stereochemicky definovanými substituentmi na každom uhlíkovom kruhu. Autori použili najmä a-k

Inteíny pod zábalmi

Inteíny pod zábalmi

predmety Poškodenie a oprava DNA Enzýmové mechanizmy Posttranslačné úpravy Predpovede proteínovej štruktúry Nucleic Acids Res. doi: 10, 1093 / nar / gkv612 Inteíny sú prvky, ktoré sa samy spájajú a ktoré sa excitujú z preložených proteínov, aby zanechali exteín alebo zrelý proteín. Väčšina funkčne rele

Minimálne informácie o klastri biosyntetických génov

Minimálne informácie o klastri biosyntetických génov

predmety biosyntéza Prírodné produkty Anotácia sekvencie Syntetická biológia Je známe, že v biosyntetických génových zhlukoch je kódovaná široká škála enzymatických dráh, ktoré produkujú špecializované metabolity v baktériách, hubách a rastlinách. Informácie o týchto zoskupeniach, dráhach a metabolitoch sú v súčasnosti v literatúre rozptýlené, čo sťažuje ich využívanie. Na uľahčenie konzistentného a systemati

Mobilizácia peptidov v imunite

Mobilizácia peptidov v imunite

predmety imunológie peptidy Využitie imunitného systému na liečenie choroby sa uľahčí lepším pochopením pôvodu a úloh peptidov v imunite. Už viac ako 30 rokov je známe, že peptidy sú rozhodujúcimi faktormi pri mobilizácii imunitného systému proti cudzím útočníkom. Odvtedy nové poznatky o tvorbe a fungovaní peptidov v imunológii podporujú úsilie o využitie imunitného systému na liečenie choroby. Väčšina z najúspešnejších liečeb

Erratum: Aminoglykozidová aktivita pozorovaná na jednotlivých pred-translokačných ribozómových komplexoch

Erratum: Aminoglykozidová aktivita pozorovaná na jednotlivých pred-translokačných ribozómových komplexoch

predmety Mechanizmus akcie ribozómu Štrukturálna biológia tRNA Pôvodný článok bol uverejnený 29. novembra 2009 Nat. Chem. Biol. 6 , 54 - 62 (2010); uverejnené online 29. novembra 2009; opravené po tlači 12. februára 2010 Vo verzii tohto článku pôvodne publikovanej v kľúči pre obrázok 6a boli jednotky pre dve koncentrácie inhibítora nesprávne označené ako „M“, kde by mali mať hodnotu „μM“. Chyba bola opravená v HTML a PDF

Erratum: Nahliadnutie do mukopolysacharidózy I zo štruktúry a pôsobenia α-L -ururidázy

Erratum: Nahliadnutie do mukopolysacharidózy I zo štruktúry a pôsobenia α-L -ururidázy

predmety Chemická biológia Poruchy metabolizmu Štrukturálna biológia Pôvodný článok bol uverejnený 11. septembra 2013 Nat. Chem. Biol. ; doi: 10, 1038 / nchembio.1357; opravené online 20. septembra 2013 Vo verzii tohto článku pôvodne publikovanej online v časti „Syntetizované inhibítory IDUA“ boli pre 5F-IdoAF uvedené dva odlišné chemické názvy a neúmyselne sa vynechal úplný názov pre 2F-IdoAF. Navyše v legende k obrázku 5

Korigendum: Molekulárne zobrazenie peroxidu vodíka vytvoreného pre bunkovú signalizáciu

Korigendum: Molekulárne zobrazenie peroxidu vodíka vytvoreného pre bunkovú signalizáciu

Pôvodný článok bol uverejnený 1. apríla 2007 Nature Chemical Biology 3 , 263 - 267 (2007); uverejnené online 1. apríla 2007; opravené po tlači 3. mája 2007 V pôvodne uverejnenej verzii tohto článku je priezvisko druhého autora nesprávne napísané. Meno autora by malo byť Orapim Tulyathan. Chyba bola oprave

Korigendum: Reverzibilné preprogramovanie bunkovej dĺžky života založené na malej molekule

Korigendum: Reverzibilné preprogramovanie bunkovej dĺžky života založené na malej molekule

Nature Chemical Biology 2 , 369 - 374 (2006); uverejnené online 11. júna 2006; opravená po tlači 22. decembra 2006 V pôvodne uverejnenej verzii tohto článku neboli vyhlásené žiadne konkurenčné finančné záujmy. Autori teraz vyhlasujú, že majú konkurenčné záujmy, ktoré by mohli byť vnímané ako ovplyvňujúce výsledky a diskusiu uvedenú v tomto článku, ktoré sú podrobne uvedené vo vyhlásení o konkurenčných finančných záujmoch priloženom k ​​článku. Chyba bola opravená v HTML a PDF verziách člán

Korigendum: Modulátory zostrihu SMN2 zvyšujú asociáciu U1-pre-mRNA a záchranu myší SMA

Korigendum: Modulátory zostrihu SMN2 zvyšujú asociáciu U1-pre-mRNA a záchranu myší SMA

Pôvodný článok bol uverejnený 1. júna 2015 Nat. Chem. Biol. 11 , 511 - 517 (2015); uverejnené online 1. júna 2015; opravené online 15. júla 2015 Autori zabudli zahrnúť opis merania hladín proteínov SMN vo vzorkách tkanív do metód online. Tento popis bol zahrnutý do HTML a PDF verzií článku. Autori Vyhľadaj Jam

Zachytávanie spolupráce

Zachytávanie spolupráce

Zohľadnenie spoločných definícií a mechanizmov kooperatívneho správania môže viesť k novým poznatkom o chemickej a biologickej funkcii. Kooperativita je dobre známa ako energetický základ pre rôzne mikroskopické udalosti, ako je súbežná chelácia kovových iónov, časová koordinácia proteínového skladania a koordinovaná funkcia biomolekulárnych súborov. Na makroúrovni je potrebná s

Čaká na RNA

Čaká na RNA

Dve Nobelove ceny za rok 2006 odrážajú ústrednú úlohu RNA v génovej regulácii a zdôrazňujú súhru objavov v chémii a biológii. RNA sa objavila popredné miesto v sérii nedávnych objavov. V decembri 2006 Nobelský výbor uznal dva takéto pokroky udelením Nobelovej ceny za chémiu Rogerovi Kornbergovi za jeho prácu na objasnení molekulárnych mechanizmov transkripcie RNA a Nobelovej ceny za fyziológiu alebo medicínu Craigovi Mellovi a Andrewovi Fireovi za ich objavenie. RNA interferencie (RNAi).

Korigendum: Dynamika spája rozpoznávanie substrátu s katalýzou v proteínovej kináze A

Korigendum: Dynamika spája rozpoznávanie substrátu s katalýzou v proteínovej kináze A

predmety Enzýmové mechanizmy kinázy Molekulárna konformácia Pôvodný článok bol uverejnený 3. októbra 2010 Nat. Chem. Biol. 6 , 821 - 828 (2010); uverejnené online 3. októbra 2010; opravené po tlači 18. apríla 2011 V pôvodne uverejnenej verzii tohto článku autori nesprávne uznali financovanie z Národných ústavov zdravia USA, GM64742. Správne číslo grantu

Presvedčivé pripomienky

Presvedčivé pripomienky

predmety Chemická biológia Vydavateľstvo Vedci musia byť pozorní, aby zabezpečili integritu zverejneného záznamu a našli nové spôsoby, ako uľahčiť vedeckú diskusiu v elektronickom veku. V našej dobe najaktuálnejších správ a sociálnych sietí sa novo publikované vedecké objavy - najmä tie, ktoré sa objavujú vo významných časopisoch - dostávajú s väčšou účinnosťou k väčšiemu počtu vedeckých divákov a širokej verejnosti. Tieto online médiá sa však čoraz viac použí

Erratum: Zvýšenie endoplazmatického retikula Ca2 + zvyšuje mutantnú proteostázu glukocerebrozidázy.

Erratum: Zvýšenie endoplazmatického retikula Ca2 + zvyšuje mutantnú proteostázu glukocerebrozidázy.

predmety Vápniková signalizácia Endoplazmatické retikulum Metabolické ochorenia Pôvodný článok bol uverejnený 9. mája 2010 Nat. Chem. Biol. 6 , 424 - 432 (2010); uverejnené online 9. mája 2010; opravené po tlači 21. mája 2010. V pôvodne publikovanej verzii tohto článku bola jedna z použitých bunkových línií nesprávne označená mutantným označením L444P s odkazom na obrázok 6a a iná bunková línia toto označenie nezahrnula s odkazom na doplnkový obrázok 11a, b. Chyby v hlavnom texte boli opravené

Oči dokorán

Oči dokorán

Pochopenie toho, ako proteíny fungujú izolovane av ich natívnom kontexte, si vyžaduje spojenie techník na molekulárnej úrovni, ktoré skúmajú súhru proteínovej štruktúry a dynamiky. Pojmy „jeden gén, jeden enzým“ a „štruktúra určuje funkciu“ sú základnými princípmi modernej biochémie. Pridajte k tomu myšlienku, že

Korigendum: Boj proti neurodegeneratívnemu ochoreniu pomocou chemických sond a modelových systémov

Korigendum: Boj proti neurodegeneratívnemu ochoreniu pomocou chemických sond a modelových systémov

predmety Biologické modely Chemická biológia Neurodegeneratívne choroby Therapeutics Nat. Chem. Biol. 10 , 911 - 920 (2014); uverejnené online 17. októbra 2014; opravené po tlači 11. decembra 2014 V pôvodne uverejnenej verzii tohto dokumentu bola položka „fáza“ pre PBT2 v tabuľke 1 neúmyselne označená ako „prerušená“. Teraz bol opravený do f

Zúženie skutočných cieľov

Zúženie skutočných cieľov

predmety Chemická genetika proteomiky Identifikácia cieľa Mnoho inhibítorov kinázy na liečbu rakoviny je neselektívnych a ich bunkové mechanizmy pôsobenia nie sú úplne pochopené. Vnorená chemická proteomika a chemická genetická stratégia odhaľujú, ktoré bunkové ciele inhibítora klinickej kinázy dasatinibu sa funkčne vzťahujú k jeho antiakogénnej aktivite. Deregulovaná signalizácia

Uvádzanie údajov do práce

Uvádzanie údajov do práce

predmety databázy Genomics Vedecká komunita Optimálne využívanie rozsiahlych súborov údajov, ktoré sa vytvárajú v postgenomickej ére, si bude vyžadovať jasné normy a záväzok otvorenej komunikácie. Chemici a biológovia tradične pokročili v oblasti vedy definovaním konkrétneho systému záujmu, sformulovaním modelov fungovania systému a testovaním týchto modelov pri zvýšených úrovniach molekulárneho rozlíšenia. Príchod nových technológií umožni

Spodný riadok

Spodný riadok

Zvýšená podpora financovania a väčšie zapojenie chemických biológov do procesu financovania sú nevyhnutné pre ďalší rozvoj v tejto oblasti. V najlepšom čase čelia akademickí vedci výzvam pri získavaní finančných prostriedkov na podporu svojho nezávislého výskumného úsilia. Nie sú to najlepšie časy. Nedávny hospodársky pokles a

Čo je v recenzii?

Čo je v recenzii?

predmety Chemická biológia Vzájomné preskúmanie Vedeckí rozhodcovia uznávajú rozhodujúcu úlohu v procese partnerského preskúmania. Čo očakávame od recenzentov časopisu Nature Chemical Biology ? Spoločné preskúmanie zostáva hlavným mechanizmom na udržanie vysokých štandardov a zabezpečenie úplnosti a presnosti vedeckých štúdií. Poskytuje tiež praktickú spä

Nájdenie seba

Nájdenie seba

predmety Vydavateľstvo Zabezpečenie dostupnosti výsledkov a záujmov vášho výskumu online rozširuje dosah vašej vedeckej práce. Vedecké publikovanie sa stalo synonymom pre vedecký výskum a poskytuje mechanizmus na zdieľanie objavov a hypotéz, ako aj na inšpirovanie budúcich snáh. Stále narastajúca veľkosť vedeckej literatúry však obmedzuje „zistiteľnosť“ nových výsledkov. Projekty spolupráce môžu navyš

Errata: Nepretržitý riadený vývoj aminoacyl-tRNA syntetáz

Errata: Nepretržitý riadený vývoj aminoacyl-tRNA syntetáz

Pôvodný článok bol uverejnený 16. októbra 2017 Nat. Chem. Biol. 13 , 1253 - 1260 (2017); uverejnené online 16. októbra 2017; opravené po tlači 1. decembra 2017 V pôvodne publikovanej verzii tohto článku boli transponované farby štítkov pre p -NF a p -IF v kľúči pre obrázok 4c. Azúrová tyčinka by mala zodpovedať p- NF a fuchsiová tyčinka by mala zodpovedať p -IF. Chyba bola opravená v HTM

Korigendum: Arginín-ramnolýza ako nová stratégia na aktiváciu faktora predĺženia translácie P

Korigendum: Arginín-ramnolýza ako nová stratégia na aktiváciu faktora predĺženia translácie P

Pôvodný článok bol uverejnený 16. februára 2015 Nat. Chem. Biol. ; doi: 10, 1038 / nchembio.1751; opravené online 24. februára 2015 Vo verzii tohto článku pôvodne publikovanej online bol druhý úvodný text druhého autora neúmyselne vynechaný. Chyba bola opravená pre tlačenú verziu, verziu PDF a HTML tohto článku. Autori Vyhľadaj Jürg

Korigendum: Allosterické peptidy viažu kasymázový zymogén a sprostredkujú tetramerizáciu kaspázy

Korigendum: Allosterické peptidy viažu kasymázový zymogén a sprostredkujú tetramerizáciu kaspázy

predmety Screening liekov Enzýmové mechanizmy Neurodegeneratívne choroby Štrukturálna biológia Pôvodný článok bol uverejnený 10. júna 2012 Nat. Chem. Biol. 8 , 655 - 660 (2012); uverejnené online 10. júna 2012; opravené po tlači 21. mája 2013 V pôvodne uverejnenej verzii tohto článku bola Irina Krylová neúmyselne uznaná a nie uvedená v zozname autorov. Zoznam autorov, príspe